RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DAAM2Q86T65 1068 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MYLIPQ8WY64 445 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TBCBQ99426 244 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ADI1Q9BV57 179 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 INCENPQ9NQS7 918 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 L1RE1Q9UN81 338 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 POLHQ9Y253 713 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CAPN8A6NHC0 703 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NUDT19A8MXV4 375 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 OPHN1O60890 802 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 LRG1P02750 347 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ITGB2P05107 769 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ZNF853P0CG23 659 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PEX2P28328 305 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GDNFP39905 211 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RASSF7Q02833 373 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NR1I3Q14994 352 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CCDC157Q569K6 752 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 FLCNQ8NFG4 579 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 WDR48Q8TAF3 677 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HDAC10Q969S8 669 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SHISA4Q96DD7 197 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PGBD4Q96DM1 585 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CCDC138Q96M89 665 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SYT17Q9BSW7 474 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 AMNQ9BXJ7 453 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.12□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 F5H423 210 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NPHP1O15259 732 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MGEA5O60502 916 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 STARD3NLO95772 234 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PRNPP04156 253 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MPOP05164 745 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SDHBP21912 280 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 IL12RB1P42701 662 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ECE1P42892 770 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GPR15P49685 360 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PRR5P85299 388 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 PFKPQ01813 784 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 IL10RAQ13651 578 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 KRT24Q2M2I5 525 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TEPPQ6URK8 271 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DPF2Q92785 391 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DDX11Q96FC9 970 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GREM2Q9H772 168 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GALNT8Q9NY28 637 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 FNIP2Q9P278 1114 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.11□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ZNF839A8K0R7 811 aa7.1□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NRP2O60462 931 aa7.1□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MMP10P09238 476 aa7.1□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TM4SF1P30408 202 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms