RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.97■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 STX6O43752 255 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAK2O60296 914 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 RFPL2O75678 378 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 PROZP22891 400 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCD1P33897 745 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 NCKAP1LP55160 1127 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 UPP1Q16831 310 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 EPSTI1Q96J88 318 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 SNX27Q96L92 541 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PODXLO00592 558 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 BRD1O95696 1058 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 KYAT1Q16773 422 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 SEZ6Q53EL9 994 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 TBX20Q9UMR3 447 aa20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNE1P15382 129 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 MCL1Q07820 350 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 STK38Q15208 465 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPAQ15257 358 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 SV2BQ7L1I2 683 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTN3Q9P232 1028 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 STK17AQ9UEE5 414 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 POLIQ9UNA4 740 aa20.94■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ASGR2P07307 311 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CLTAP09496 248 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 OR1D2P34982 312 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 BRCC3P46736 316 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 XKR4Q5GH76 650 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 LILRA6Q6PI73 481 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 DYMQ7RTS9 669 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM212AQ96EL1 285 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CLIC6Q96NY7 704 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 MTMR6Q9Y217 621 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CLUHO75153 1309 aa20.93■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 I3L4J1 428 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 XYLBO75191 536 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ZMYND10O75800 440 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FGFR3P22607 806 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 MCM4P33991 863 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PLA2G5P39877 138 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF12Q96FN5 646 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.92■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 H7C4K7 107 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ABLIM1O14639 778 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 C8AP07357 584 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CXCL8P10145 99 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ELF1P32519 619 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 STAT6P42226 847 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF131P52739 623 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 USP49Q70CQ1 688 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 USP28Q96RU2 1077 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 PANK2Q9BZ23 570 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 MTRRQ9UBK8 725 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.91■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 OGTO15294 1046 aa20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ARPP19P56211 112 aa20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC39A14Q15043 492 aa20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54-211ENST00000609454 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms