RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC78	A2IDD5	438 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	POMC	P01189	267 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	RAP2A	P10114	183 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	FGFR4	P22455	802 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	GCSH	P23434	173 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	STRN3	Q13033	797 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652		Q6ZNX1	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZNF559-209	ENST00000591652	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	PRSS23	O95084	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	C1R	P00736	705 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MTHFD2	P13995	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ATP5J	P18859	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC6A2	P23975	617 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ALDH1A3	P47895	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	GYS2	P54840	703 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	PER3	P56645	1201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ANO4	Q32M45	955 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	DUSP26	Q9BV47	211 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MGST3	O14880	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	GPANK1	O95872	356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	FPR1	P21462	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	RARRES1	P49788	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	HSD11B2	P80365	405 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	UBR7	Q8N806	425 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	VTA1	Q9NP79	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CASS4	Q9NQ75	786 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MCAM	P43121	646 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MYOC	Q99972	504 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	C1QL1	O75973	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ENDOD1	O94919	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MATN4	O95460	622 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CDK4	P11802	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CKB	P12277	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SCAND1	P57086	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	NHLH1	Q02575	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MALL	Q13021	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SEPT2	Q15019	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	MYADML2	A6NDP7	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	TEX33	O43247	280 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	BRINP1	O60477	761 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	PCSK1	P29120	753 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC6A9	P48067	706 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	VAV2	P52735	878 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF559-209	ENST00000591652	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms