RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP8B3O60423 1300 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MYADML2A6NDP7 307 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 USP27XA6NNY8 438 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DRAP01903 254 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG3L1P0CL83 205 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 GRM5P41594 1212 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEA1P43355 309 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM32Q13049 653 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 OSMRQ99650 979 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 DERAQ9Y315 318 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM17Q9Y577 477 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 KBTBD13C9JR72 458 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM189A1O60320 539 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 EDN1P05305 212 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 P4HA1P13674 534 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA4Q13772 614 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX17Q15036 470 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ACLYP53396 1101 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 HGSNATQ68CP4 663 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SERINC5Q86VE9 423 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF592Q92610 1267 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CPB2Q96IY4 423 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 EVI5O60447 810 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFAIP3P21580 790 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CASQ1P31415 396 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 USP8P40818 1118 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 GNG11P61952 73 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 PTK7Q13308 1070 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC39CQ8N584 583 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 C2CD2Q9Y426 696 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR182O15218 404 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCF3P0C7M6 154 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ATICP31939 592 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFSF9P41273 254 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 OSTNP61366 133 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGA7Q13683 1181 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 PTGISQ16647 500 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 GJB7Q6PEY0 223 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 USP38Q8NB14 1042 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-212ENST00000591041 PDE6CP51160 858 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 APBA1Q02410 837 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 PTK2Q05397 1052 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SHC3Q92529 594 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF516Q92618 1163 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SEMA4DQ92854 862 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TACC1O75410 805 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6KA5O75582 802 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL8P10145 99 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 SEZ6Q53EL9 994 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF677Q86XU0 584 aa24.33■■□□□ 1.49
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