RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 NFIBO00712 420 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FRS3O43559 492 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDH8O95206 1070 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FUT4P22083 530 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AOAHP28039 575 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXC9P31274 260 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MCAMP43121 646 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STT3AP46977 705 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB1AP62820 205 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ROM1Q03395 351 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP3CAQ08209 521 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BNIP3Q12983 259 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTN1Q14203 1278 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC157Q569K6 752 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC14L1Q92503 715 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL8AQ96BM9 186 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TBATAQ96M53 351 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN18Q99952 460 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GREM2Q9H772 168 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PALD1Q9ULE6 856 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PADI4Q9UM07 663 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 USP18Q9UMW8 372 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K5Q99683 1374 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DCCP43146 1447 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CHL1O00533 1208 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF18O76093 207 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MPIG6BO95866 241 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FAHP16930 419 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MC4RP32245 332 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK9P45984 424 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK10P53779 464 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FGL2Q14314 439 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC38Q502W7 563 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GAREM2Q75VX8 874 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MCM10Q7L590 875 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPYL6Q8N831 410 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP43Q8NFH3 380 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 IL17REQ8NFR9 667 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 IL31RAQ8NI17 732 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GAB3Q8WWW8 586 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKS1AQ92625 1134 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SKA1Q96BD8 255 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GCC1Q96CN9 775 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ADI1Q9BV57 179 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MTG2Q9H4K7 406 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STAP2Q9UGK3 403 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 USP19O94966 1318 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRCP08575 1304 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCC6O95255 1503 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 POM121BA6NF01 834 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R3H8 397 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A6O15403 523 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PAPLNO95428 1278 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 LDHCP07864 332 aa4.87□□□□□ -1.63
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