RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 C8AP07357 584 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 POU2F2P09086 479 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 KCNE1P15382 129 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 MCM2P49736 904 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 KCND2Q9NZV8 630 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 WNT16Q9UBV4 365 aa20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 RTL10Q7L3V2 364 aa20.03■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 ACAP3Q96P50 834 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 TCHPQ9BT92 498 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 NOTCH4Q99466 2003 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 PROB1E7EW31 1015 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 PODXLO00592 558 aa20■□□□□ 0.79
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CTIF-206ENST00000588345 CDH7Q9ULB5 785 aa20■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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CTIF-206ENST00000588345 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 SLC10A6Q3KNW5 377 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 ARSHQ5FYA8 562 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 SLC8B1Q6J4K2 584 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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CTIF-206ENST00000588345 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.99■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 H0YCG3 227 aa19.98■□□□□ 0.79
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D4O60343 1298 aa19.98■□□□□ 0.79
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