RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CLUL1	Q15846	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MYOC	Q99972	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PTPRM	P28827	1452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SOGA1	O94964	1423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PRSS23	O95084	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	IL2RB	P14784	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MAK	P20794	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CHN2	P52757	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HSPA2	P54652	639 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PER3	P56645	1201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	USP51	Q70EK9	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	HAS1	Q92839	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	COA7	Q96BR5	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	LPXN	O60711	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NCR1	O76036	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RECQL4	O94761	1208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ITGB1	P05556	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ELANE	P08246	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A2	P23975	617 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MGAT1	P26572	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	FHL2	Q14192	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	POGK	Q9P215	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.57	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	GPR32	O75388	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RAP2A	P10114	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ATP5J	P18859	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	DDC	P20711	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PTGS2	P35354	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RAP2B	P61225	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	IL10RA	Q13651	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ACAP2	Q15057	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
COX11-208	ENST00000576084	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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