RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MAPK6Q16659 721 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM50Q86XT4 487 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF677Q86XU0 584 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 HES6Q96HZ4 224 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 APBA2Q99767 749 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 EHD2Q9NZN4 543 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 STIM2Q9P246 746 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 PRKCBP05771 671 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 KRT5P13647 590 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CHRNB2P17787 502 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 FLT3LGP49771 235 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 SURF1Q15526 300 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 PALB2Q86YC2 1186 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF516Q92618 1163 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 KATNBL1Q9H079 304 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ASAP2O43150 1006 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CEP104O60308 925 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 MTA2O94776 668 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 GNRH1P01148 92 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 GH1P01241 217 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 FMO1Q01740 532 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 PRKCZQ05513 592 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 TAF3Q5VWG9 929 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 TATDN2Q93075 761 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-204ENST00000575194 MSCO60682 206 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGAP1Q07960 439 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 DRP2Q13474 957 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 CASP8Q14790 479 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 CCL14Q16627 93 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 RNF149Q8NC42 400 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 SRRDQ9UH36 339 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC188H7C350 402 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 OGTO15294 1046 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 MMEP08473 750 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 WDR49Q8IV35 697 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 IFT20Q8IY31 132 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 METTL13Q8N6R0 699 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 COPS5Q92905 334 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 COL1A2P08123 1366 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 PHACTR2O75167 634 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 HOXD10P28358 340 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 MCL1Q07820 350 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 IRF5Q13568 498 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM11Q96F44 468 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TCHPQ9BT92 498 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-204ENST00000575194 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms