RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ZNF677Q86XU0 584 aa24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 FBXO40Q9UH90 709 aa24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 BIRC3Q13489 604 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SRLQ86TD4 932 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.82■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MYO1FO00160 1098 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 EDN1P05305 212 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RFC5P40937 340 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RWDD2BP57060 319 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CYP1B1Q16678 543 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SNX24Q9Y343 169 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TULP2O00295 520 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 EDNRBP24530 442 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 BPIFB4P59827 614 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 DLK2Q6UY11 383 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.81■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 A0A0B4J269 797 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CGRRF1Q99675 332 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CENPHQ9H3R5 247 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MAPK4P31152 587 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ERLIN2O94905 339 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 MYBL1P10243 752 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RARAP10276 462 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CUL2Q13617 745 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CAPSQ13938 189 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TRIM11Q96F44 468 aa24.79■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 PODXLO00592 558 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 PLTPP55058 493 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RRM1P23921 792 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 STAT5BP51692 787 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 GUCY1A3Q02108 690 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CENPCQ03188 943 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 NEDD9Q14511 834 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TRIM7Q9C029 511 aa24.78■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 ADCY3O60266 1144 aa24.77■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.77■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.77■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.77■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 CLTAP09496 248 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 GBP1P32455 592 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 CCT5P48643 541 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 MON1BQ7L1V2 547 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 CSADQ9Y600 493 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 CLDN3O15551 220 aa24.76■■□□□ 1.55
EHD4-202ENST00000569223 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms