RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 TP53BP2Q13625 1128 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SUSD4Q5VX71 490 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CDHR1Q96JP9 859 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RHBGQ9H310 441 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CD274Q9NZQ7 290 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ABCC12Q96J65 1359 aa8.9□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SUN1O94901 812 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 GFAPP14136 432 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 DR1Q01658 176 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CASP8Q14790 479 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TAF13Q15543 124 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CEP78Q5JTW2 689 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 NLRP14Q86W24 1093 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 EPN3Q9H201 632 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 AAASQ9NRG9 546 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 H0Y3Z8 333 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RPS6KA5O75582 802 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CDK8P49336 464 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CDH18Q13634 790 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FKBP9O95302 570 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FOSL2P15408 326 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RESP18Q5W5W9 173 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 IYDQ6PHW0 289 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 BTBD9Q96Q07 612 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 PCNAP12004 261 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FLT3P36888 993 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 AP3B2Q13367 1082 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 LRRC14Q15048 493 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 JAMLQ86YT9 394 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 VSTM4Q8IW00 320 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 LZTS1Q9Y250 596 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ITSN1Q15811 1721 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ARHGEF9O43307 516 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 WDR47O94967 919 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ECEL1O95672 775 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TMPRSS15P98073 1019 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ITGADQ13349 1161 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 MTBPQ96DY7 904 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 AURKCQ9UQB9 309 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 AFF2P51816 1311 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SUPT3HO75486 399 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 COPS2P61201 443 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CSNK2BP67870 215 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 MAN2A1Q16706 1144 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TTC23Q5W5X9 447 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 NLRP10Q86W26 655 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RABGGTAQ92696 567 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FAM136AQ96C01 138 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.89□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 FCGRTP55899 365 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 AMHR2Q16671 573 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 GNASQ5JWF2 1037 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 TMEM270Q6UE05 265 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 UBE4BO95155 1302 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 SLC16A4O15374 487 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 KLRC2P26717 231 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RGS7P49802 495 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CCR4P51679 360 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 EPHB4P54760 987 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 HMGCS2P54868 508 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 MAP3K10Q02779 954 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.88□□□□□ -0.99
PDPR-210ENST00000568530 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms