RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 CXCR5P32302 372 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CLCN6P51797 869 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 NCOA4Q13772 614 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 AMHR2Q16671 573 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PSMB7Q99436 277 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ARID3AQ99856 593 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 THAP2Q9H0W7 228 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CDT1Q9H211 546 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 MMEP08473 750 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CYP2B6P20813 491 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SREBF2Q12772 1141 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CCL14Q16627 93 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CCDC102AQ96A19 550 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RNF14Q9UBS8 474 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 GJD2Q9UKL4 321 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CYP2C19P33261 490 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ITIH3Q06033 890 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CUL2Q13617 745 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 DUOXA2Q1HG44 320 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TLK2Q86UE8 772 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 FAM212AQ96EL1 285 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PPP1R16BQ96T49 567 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 APBA2Q99767 749 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 F2P00734 622 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CLTAP09496 248 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TCEAL1Q15170 157 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RPS6KA1Q15418 735 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 OSGEPQ9NPF4 335 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 B4GALT4O60513 344 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 IGHA2P01877 340 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 MCF2P10911 925 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PAFAH1B1P43034 410 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 BPIFB4P59827 614 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CRHR2Q13324 411 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CCDC181Q5TID7 509 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CEP120Q8N960 986 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 NLRP7Q8WX94 980 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SETD4Q9NVD3 440 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 GPR25O00155 361 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 KIF4AO95239 1232 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 GPC5P78333 572 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ZNF410Q86VK4 478 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TAF4BQ92750 862 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 KAT2BQ92831 832 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RAB21Q9UL25 225 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CES2O00748 559 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 IL18RAPO95256 599 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 OSTNP61366 133 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 DAAM2Q86T65 1068 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ZNF677Q86XU0 584 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ABCB6Q9NP58 842 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 Q9Y3F1 56 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TUBBP07437 444 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 TM4SF4P48230 202 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 BRD3Q15059 726 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PEX26Q7Z412 305 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTU2-210ENST00000567949 PNKPQ96T60 521 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms