RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 VPS11Q9H270 941 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 HPS4Q9NQG7 708 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MALT1Q9UDY8 824 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 AK5Q9Y6K8 562 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 PREX1Q8TCU6 1659 aa5.94□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SSH2Q76I76 1423 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM221A6NGB7 291 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RSPH10B2B2RC85 870 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 LINC01387J3KSC0 135 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MTSS1O43312 755 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 B4GALT4O60513 344 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MAFKO60675 156 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 OPN1MWP04001 364 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RSPH10BP0C881 870 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 EPB41P11171 864 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TKTL1P51854 596 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 DSTNP60981 165 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 PPFIA1Q13136 1202 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MTX1Q13505 466 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NFE2L1Q14494 772 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC38Q502W7 563 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ADALQ6DHV7 355 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 C8orf74Q6P047 294 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.93□□□□□ -1.46
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CAPN3-211ENST00000562199 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 OR52K1Q8NGK4 314 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GPT2Q8TD30 523 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GPR152Q8TDT2 470 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RNF139Q8WU17 664 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 FERMT2Q96AC1 680 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA17Q96L03 361 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 FNBP1Q96RU3 617 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 WDR24Q96S15 920 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GAL3ST1Q99999 423 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 USP26Q9BXU7 913 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM5Q9C035 493 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NT5C3AQ9H0P0 336 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 DCTPP1Q9H773 170 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TNKSO95271 1327 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MROH5Q6ZUA9 1318 aa5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 ITSN1Q15811 1721 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 SLC12A8A0AV02 714 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 CTAGE9A4FU28 777 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 F8W735 103 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 H3BRJ5 948 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 GABRDO14764 452 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK13O15264 365 aa5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CAPN3-211ENST00000562199 TEX28O15482 410 aa5.92□□□□□ -1.46
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