RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	LAD1	O00515	517 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	C8A	P07357	584 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ITGA4	P13612	1032 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	AKAP5	P24588	427 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SFN	P31947	248 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PRPH	P41219	470 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TXK	P42681	527 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	JAK3	P52333	1124 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NPEPPS	P55786	919 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ADCY1	Q08828	1119 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CSRP2	Q16527	193 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RDM1	Q8NG50	284 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TM4SF5	O14894	197 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	BMP15	O95972	392 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PROS1	P07225	676 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NUCB2	P80303	420 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	WDR44	Q5JSH3	913 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MTSS1L	Q765P7	747 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CEP57	Q86XR8	500 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	USP28	Q96RU2	1077 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CLIC4	Q9Y696	253 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	EML1	O00423	815 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	GIPC1	O14908	333 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	AXIN1	O15169	862 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CEBPB	P17676	345 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PTPA	Q15257	358 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	IL17A	Q16552	155 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ANO5	Q75V66	913 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZNF410	Q86VK4	478 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CHRD	Q9H2X0	955 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	DPP7	Q9UHL4	492 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NCAN	O14594	1321 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PFKP	Q01813	784 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	USP41	Q3LFD5	358 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ATL3	Q6DD88	541 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222		Q6ZS52	159 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FNIP2	Q9P278	1114 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FCAR	P24071	287 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	DNM2	P50570	870 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SHC2	P98077	582 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	PDIA5	Q14554	519 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	SLC39A14	Q15043	492 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	EPHA7	Q15375	998 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-231	ENST00000552222	CARNS1	A5YM72	827 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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