RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.72□□□□□ -1.33
GNPTAB-208ENST00000550718 K7ESF4 209 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR3P46089 330 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 C21orf58P58505 322 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 OCA2Q04671 838 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ADI1Q9BV57 179 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 VTA1Q9NP79 307 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.71□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MYADML2A6NDP7 307 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 WNT10BO00744 389 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ITGAMP11215 1152 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CXCR5P32302 372 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MTNR1BP49286 362 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SCAND1P57086 179 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TOR2AQ5JU69 321 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MASP2O00187 686 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 RAP2AP10114 183 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ALAS1P13196 640 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 RAP2BP61225 183 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CXADRP78310 365 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR149Q86SP6 731 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CAGE1Q8TC20 777 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.69□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR39O43194 453 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ALDH1A3P47895 512 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 COLEC12Q5KU26 742 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SDE2Q6IQ49 451 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FGFR4P22455 802 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC6A9P48067 706 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TMPRSS15P98073 1019 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 NOMO1Q15155 1222 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF529Q6P280 563 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MED15Q96RN5 788 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR32O75388 356 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPANK1O95872 356 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CKBP12277 381 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ERVK-21P61565 698 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP8B2P98198 1209 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 MTM1Q13496 603 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SEPT2Q15019 361 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 DACT2Q5SW24 774 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 Q6ZNX1 250 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 Q96MF0 132 aa6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 PRKD3O94806 890 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CLSTN1O94985 981 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FPR1P21462 350 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 PCSK1P29120 753 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 WASP42768 502 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 RARRES1P49788 294 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 CYP2A13Q16696 494 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms