RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PARP2Q9UGN5 583 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 COL4A6Q14031 1691 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CITO14578 2027 aa8.83□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ARL5CA6NH57 179 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PPEF2O14830 753 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 EVI5O60447 810 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 B4GALT3O60512 393 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 IL18RAPO95256 599 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 VNN1O95497 513 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FGFR1P11362 822 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ITGA4P13612 1032 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RFC2P35250 354 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 MXI1P50539 228 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RAB27AP51159 221 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 DEFB103AP81534 67 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 MYL7Q01449 175 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 UBXN1Q04323 297 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ENPEPQ07075 957 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SYCP1Q15431 976 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ZBTB6Q15916 424 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KYAT1Q16773 422 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ZACNQ401N2 412 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 EPC2Q52LR7 807 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SV2AQ7L0J3 742 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 WDR49Q8IV35 697 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM199Q8N511 208 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 LMO3Q8TAP4 145 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CXorf38Q8TB03 319 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 APBB2Q92870 758 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KIF12Q96FN5 646 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FNBP1Q96RU3 617 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SIX2Q9NPC8 291 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HCSTQ9UBK5 93 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SIX4Q9UIU6 781 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 LAMA3Q16787 3333 aa8.82□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TTC3P53804 2025 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 OFD1O75665 1012 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HLA-DRAP01903 254 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ACTN1P12814 892 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KCNE1P15382 129 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TNNI1P19237 187 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SLC9A1P19634 815 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SCNN1GP51170 649 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NAB2Q15742 525 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 VSTM4Q8IW00 320 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 HELQQ8TDG4 1101 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ASB7Q9H672 318 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RSAD1Q9HA92 442 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 IL23AQ9NPF7 189 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GCNT4Q9P109 453 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 C2CD2Q9Y426 696 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PTPRSQ13332 1948 aa8.81□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CACNA1AO00555 2505 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PMM2O15305 246 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 INPPL1O15357 1258 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CBFA2T2O43439 604 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NOL4O94818 638 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 POMCP01189 267 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 SKIP12755 728 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 PON1P27169 355 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CDC25BP30305 580 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GTF2H1P32780 548 aa8.8□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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