RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 FNIP2Q9P278 1114 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 137.9
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CTDSP2-203ENST00000547701 PAPLNO95428 1278 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 MYL1P05976 194 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 URODP06132 367 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 GLUD2P49448 558 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 ACCSQ96QU6 501 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTDSP2-203ENST00000547701 VWA8A3KMH1 1905 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 F8W810 466 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TADA2AO75478 443 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 IDEP14735 1019 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP3A5P20815 502 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 OSTNP61366 133 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CREMQ03060 361 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 UNC13DQ70J99 1090 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM206Q9H813 350 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ANK1P16157 1881 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.37■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CSPG5O95196 566 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 KIF4AO95239 1232 aa25.37■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 PDXDC1Q6P996 788 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 SUSD6Q92537 303 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 S1PR5Q9H228 398 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 PFKFB1P16118 471 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 GARTP22102 1010 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ADSSP30520 456 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 LRPAP1P30533 357 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CASP5P51878 434 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ASB7Q9H672 318 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 GCNT3O95395 438 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 CLCN4P51793 760 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CLCNKBP51801 687 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.34■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 B3GAT3O94766 335 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 IL9P15248 144 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 FGFR3P22607 806 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 PAX3P23760 479 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TNFSF9P41273 254 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TTPALQ9BTX7 342 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 DPP7Q9UHL4 492 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
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CTDSP2-203ENST00000547701 UBE4BO95155 1302 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 C5orf42Q9H799 3197 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A1B0GVL5 298 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 TEX28O15482 410 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 MYBP10242 640 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 ASIC1P78348 528 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
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