RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FZD1Q9UP38 647 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.21□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF185O15231 689 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SGTAO43765 313 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ITGB1P05556 798 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ALAS1P13196 640 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LAG3P18627 525 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CTXN1P60606 82 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FAM189BP81408 668 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 KLF10Q13118 480 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 METRNLQ641Q3 311 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MED25Q71SY5 747 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MRGPREQ86SM8 312 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RAB24Q969Q5 203 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TMX3Q96JJ7 454 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MYOCQ99972 504 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.2□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NCR1O76036 304 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SLPIP03973 132 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 EDNRBP24530 442 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CREMQ03060 361 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 IL10RAQ13651 578 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MIER2Q8N344 545 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NEU1Q99519 415 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TEX101Q9BY14 249 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.19□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 ABHD16AO95870 558 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NEK2P51955 445 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FHL2Q14192 279 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM240Q5SV17 173 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 DACT2Q5SW24 774 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 AMER2Q8N7J2 671 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 IFI44Q8TCB0 444 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 KAT5Q92993 513 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CEP89Q96ST8 783 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.18□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NDUFA10O95299 355 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 HLA-DOAP06340 250 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 SLC6A2P23975 617 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RAB39AQ14964 217 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MLST8Q9BVC4 326 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.17□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PDGFRBP09619 1106 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 GCSHP23434 173 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MXRA7P84157 204 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 PTPAQ15257 358 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CPA6Q8N4T0 437 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 FITM2Q8N6M3 262 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.16□□□□□ -1.42
CCDC82-208ENST00000545264 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms