RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533719.1

AIFM1-208, Transcript of apoptosis inducing factor mitochondria associated 1, human

TSL 2

Gene AIFM1, Length 845 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AIFM1-208	ENST00000533719	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	C2CD2	Q9Y426	696 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ANK1	P16157	1881 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LRRN2	O75325	713 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	FER	P16591	822 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CD52	P31358	61 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	RAB27A	P51159	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	JAM2	P57087	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CDK17	Q00537	523 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LPIN1	Q14693	890 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	DERA	Q9Y315	318 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	IPP	Q9Y573	584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SGPL1	O95470	568 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	VNN1	O95497	513 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SERPING1	P05155	500 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC175	P0C221	793 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SELP	P16109	830 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SOX5	P35711	763 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	MFAP3	P55082	362 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	GCNT1	Q02742	428 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ARID5A	Q03989	594 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	HES2	Q9Y543	173 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	GFPT2	O94808	682 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ITGB3	P05106	788 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	KRT19	P08727	400 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	GJA8	P48165	433 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CDK7	P50613	346 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	KIF11	P52732	1056 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CUL2	Q13617	745 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	MTF1	Q14872	753 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	VPS36	Q86VN1	386 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.66	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms