RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478		M0R2C6	588 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GSTA4	O15217	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PMM2	O15305	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DLX3	O60479	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MSC	O60682	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FLOT1	O75955	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MBD4	O95243	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MT-CO1	P00395	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PGK2	P07205	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	HOXC6	P09630	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RBP3	P10745	1247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GLB1	P16278	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MCC	P23508	829 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GRIA2	P42262	883 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RNF4	P78317	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ICA1	Q05084	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	KCTD2	Q14681	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CCT6B	Q92526	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	BAD	Q92934	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SCLY	Q96I15	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CBX4	O00257	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CLGN	O14967	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FANCG	O15287	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SEPT4	O43236	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	STRN	O43815	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DNAJA2	O60884	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	NBN	O60934	754 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CRTAM	O95727	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PGK1	P00558	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FCER1A	P12319	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CD247	P20963	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ITGB8	P26012	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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