RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527006.1

TSTA3-205, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-205ENST00000527006 TOP1MTQ969P6 601 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RNF39Q9H2S5 420 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 KLK14Q9P0G3 267 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.51■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 LGALS16A8MUM7 142 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 OFD1O75665 1012 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PAX3P23760 479 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MLH1P40692 756 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 FMO5P49326 533 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RGS19P49795 217 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MXI1P50539 228 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 UBXN1Q04323 297 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 GRIK3Q13003 919 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 JADE1Q6IE81 842 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 GBP6Q6ZN66 633 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 LPPQ93052 612 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 UROC1Q96N76 676 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SLC9A7Q96T83 725 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 GAD1Q99259 594 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.5■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ALPK3Q96L96 1907 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 A0A1B0GTH6 734 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 FSD2A1L4K1 749 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 INPPL1O15357 1258 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 UPP2O95045 317 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TRIM49P0CI25 452 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TRIM49CP0CI26 452 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 GCLMP48507 274 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RBP5P82980 135 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MYL7Q01449 175 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 WDR44Q5JSH3 913 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 HELQQ8TDG4 1101 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 FAM81BQ96LP2 452 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 20.9
TSTA3-205ENST00000527006 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DPP3Q9NY33 737 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 IFNKQ9P0W0 207 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SCN5AQ14524 2016 aa15.49■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ATICP31939 592 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PNPLA4P41247 253 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DLG4P78352 724 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MYO1EQ12965 1108 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 NR1I3Q14994 352 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZACNQ401N2 412 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SV2AQ7L0J3 742 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TAF4BQ92750 862 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 VWCEQ96DN2 955 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 IQCDQ96DY2 449 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa15.48■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 DGKIO75912 1065 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 CLSTN1O94985 981 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 POMCP01189 267 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 NFICP08651 508 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 KRT19P08727 400 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TPM1P09493 284 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 P4HA1P13674 534 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 SCNN1GP51170 649 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PPP3CAQ08209 521 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TUSC3Q13454 348 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZBTB6Q15916 424 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 TCTN1Q2MV58 587 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MIIPQ5JXC2 388 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 LRRC43Q8N309 656 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZFP42Q96MM3 310 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 ZNF560Q96MR9 790 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 NUP58Q9BVL2 599 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 RAB20Q9NX57 234 aa15.47■□□□□ 0.07
TSTA3-205ENST00000527006 INSL6Q9Y581 213 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms