RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521418.1

POLB-210, Transcript of DNA polymerase beta, humanhuman

TSL 2

Gene POLB, Length 628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLB-210ENST00000521418 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CCDC6Q16204 474 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PSMD5Q16401 504 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CEP57Q86XR8 500 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ING5Q8WYH8 240 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MTA3Q9BTC8 594 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GPR88Q9GZN0 384 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 K7ESF4 209 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CAVIN2O95810 425 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RHOP08100 348 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MLH1P40692 756 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RPIAP49247 311 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MMP16P51512 607 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRR20EP86478 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRR20CP86479 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRR20DP86480 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRR20BP86481 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRR20AP86496 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 FGD1P98174 961 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CREB5Q02930 508 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 DSC1Q08554 894 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 LMAN2Q12907 356 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GRIK3Q13003 919 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GRM2Q14416 872 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MTERF2Q49AM1 385 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 XKR3Q5GH77 459 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 IQCEQ6IPM2 695 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NOTUMQ6P988 496 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PROSER1Q86XN7 944 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 LEMD2Q8NC56 503 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RDM1Q8NG50 284 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 DISC1Q9NRI5 854 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PPME1Q9Y570 386 aa7.12□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PRRG1O14668 218 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ASAP2O43150 1006 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TRAPPC3O43617 180 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GAS7O60861 476 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 DPP6P42658 865 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SCNN1GP51170 649 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 AMPD2Q01433 879 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RAB33AQ14088 237 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 Q6ZNB5 142 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 KBTBD6Q86V97 674 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TCP11Q8WWU5 503 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SMARCD2Q92925 531 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GAD1Q99259 594 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 WASF3Q9UPY6 502 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.1□□□□□ -1.27
POLB-210ENST00000521418 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms