RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511595.5

FAM53C-209, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 3

Gene FAM53C, Length 551 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-209	ENST00000511595	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MGST3	O14880	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PRSS23	O95084	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SREBF1	P36956	1147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RARRES1	P49788	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SESN3	P58005	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RAP2B	P61225	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CXADR	P78310	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MXRA7	P84157	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ADRM1	Q16186	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595		Q6ZNX1	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	NELL1	Q92832	810 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ULK1	O75385	1050 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	MATN4	O95460	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	GCSH	P23434	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	NHLH1	Q02575	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	STAT4	Q14765	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FGFR4	P22455	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC6A2	P23975	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	ECHS1	P30084	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FATE1	Q969F0	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	GREM2	Q9H772	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	C1R	P00736	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	POMC	P01189	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	IL2RB	P14784	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FOXF2	Q12947	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	GPR39	O43194	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	EYA4	O95677	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	CDK4	P11802	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	ATP5J	P18859	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	FPR1	P21462	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	HSD11B2	P80365	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM53C-209	ENST00000511595	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms