RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 EXOC1Q9NV70 894 aa22.51■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 UBE4BO95155 1302 aa22.51■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 MUC3AQ02505 3323 aa22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 TISP43B9A030 160 aa22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.5■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 ADAM15Q13444 863 aa22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 UPP1Q16831 310 aa22.5■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.5■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.5■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.49■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 FUT10Q6P4F1 479 aa22.49■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.49■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.49■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 CLDND1Q9NY35 253 aa22.49■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.198e-6■■■■■ 107
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DDR1-255ENST00000504927 DPYDQ12882 1025 aa22.48■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 ASB2Q96Q27 587 aa22.48■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.48■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 KIF4AO95239 1232 aa22.47■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 URODP06132 367 aa22.47■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.47■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.198e-7■■■■□ 24.7
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DDR1-255ENST00000504927 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.47■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.47■■□□□ 1.19
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DDR1-255ENST00000504927 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.46■■□□□ 1.19
DDR1-255ENST00000504927 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.46■■□□□ 1.19
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