RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 RABGGTAQ92696 567 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 P2RX5Q93086 422 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 SAMD11Q96NU1 681 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 MIOSQ9NXC5 875 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 PTGESO14684 152 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM189A1O60320 539 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 DDHD2O94830 711 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 ALDH2P05091 517 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 COL9A1P20849 921 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 BMP6P22004 513 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 BMPR1AP36894 532 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRP12P59046 1061 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAM9Q13443 819 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TUSC3Q13454 348 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 NFKBIBQ15653 356 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 EPC2Q52LR7 807 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 JADE1Q6IE81 842 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CD302Q8IX05 232 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 MLKLQ8NB16 471 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 FNBP1Q96RU3 617 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CWH43Q9H720 699 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CNTN3Q9P232 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 REV3LO60673 3130 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC26A0AVF1 554 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CETN3O15182 167 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 NFICP08651 508 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNE1P15382 129 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CCNE1P24864 410 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PPM1AP35813 382 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC11A1P49279 550 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ERVK-21P61565 698 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT17Q04695 432 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC63Q05C16 580 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 BEST2Q8NFU1 509 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 HASPINQ8TF76 798 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM169Q96HH4 297 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ASB2Q96Q27 587 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SPG21Q9NZD8 308 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 COL4A6Q14031 1691 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 NCOR1O75376 2440 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 INPPL1O15357 1258 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 B4GALT3O60512 393 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TADA2AO75478 443 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 FGF18O76093 207 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT13P13646 458 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TNNI1P19237 187 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 GPM6BQ13491 265 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 STX1AQ16623 288 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPPQ6IPU0 288 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms