RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 HDXQ7Z353 690 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RNF149Q8NC42 400 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 KATNBL1Q9H079 304 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TRPC6Q9Y210 931 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ABLIM1O14639 778 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 VNN1O95497 513 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GH1P01241 217 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MMEP08473 750 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3CAP42336 1068 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GPC5P78333 572 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 WDR44Q5JSH3 913 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TAF3Q5VWG9 929 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 METTL13Q8N6R0 699 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 USP38Q8NB14 1042 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FAM84AQ96KN4 292 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACP6Q9NPH0 428 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 AMFRQ9UKV5 643 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 COG5Q9UP83 839 aa8.81□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ASAP2O43150 1006 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MTA2O94776 668 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS2P05162 132 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 AP3M2P53677 418 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MCL1Q07820 350 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 BIRC3Q13489 604 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TFDP1Q14186 410 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GRB14Q14449 540 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf74Q6P047 294 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PPTC7Q8NI37 304 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FZD8Q9H461 694 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 OGTO15294 1046 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FKTNO75072 461 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 C22orf31O95567 290 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PROZP22891 400 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TNFSF9P41273 254 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PTENP60484 403 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GPR142Q7Z601 462 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF677Q86XU0 584 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 WDR49Q8IV35 697 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 STIM2Q9P246 746 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CITO14578 2027 aa8.8□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACKR2O00590 384 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CEP104O60308 925 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYND10O75800 440 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 KRT5P13647 590 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TNFRSF8P28908 595 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 LBX1P52954 281 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 BPIFB4P59827 614 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 POU5F1BQ06416 359 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CASP8Q14790 479 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SURF1Q15526 300 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PTPROQ16827 1216 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SEZ6Q53EL9 994 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TCHPQ9BT92 498 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 COL1A2P08123 1366 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms