RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730		F8VZ95	297 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM66	O15016	1216 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MGAM	O43451	1857 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	EDN1	P05305	212 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	RARB	P10826	455 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	AKR1A1	P14550	325 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CHRNB2	P17787	502 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CCND2	P30279	289 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SOX5	P35711	763 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GCGR	P47871	477 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PEX3	P56589	373 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMC5	P62195	406 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	BFSP1	Q12934	665 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	XKR9	Q5GH70	373 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM58	Q8NG06	486 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MORC4	Q8TE76	937 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP7	Q8WX94	980 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	COPS5	Q92905	334 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PCYT2	Q99447	389 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	KATNBL1	Q9H079	304 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	VTA1	Q9NP79	307 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ACP6	Q9NPH0	428 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	KCND2	Q9NZV8	630 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		6.29	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	NCAN	O14594	1321 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MCM3AP	O60318	1980 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SOBP	A7XYQ1	873 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	AGPS	O00116	658 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ADCY6	O43306	1168 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOC3	O60645	756 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MSC	O60682	206 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CD46	P15529	392 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	EDNRB	P24530	442 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	NPTX2	P47972	431 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GCLM	P48507	274 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	DNA2	P51530	1060 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	VAMP7	P51809	220 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	JAK3	P52333	1124 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	GALC	P54803	685 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	BEX3	Q00994	111 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MYL7	Q01449	175 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ITIH3	Q06033	890 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	MYBPC2	Q14324	1141 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL4	Q14679	1199 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	CASP8	Q14790	479 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNA10	Q16322	511 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		6.28	□□□□□ -1.4
C4BPB-208	ENST00000492730	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		6.28	□□□□□ -1.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms