RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491859.5

USP19-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-215ENST00000491859 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 UROC1Q96N76 676 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 ACCSQ96QU6 501 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.21■□□□□ 0.83
USP19-215ENST00000491859 A0A1B0GVL5 298 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CMA1P23946 247 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 AFMP43652 599 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CLCNKBP51801 687 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KCNA1Q09470 495 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ALCAMQ13740 583 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 USP41Q3LFD5 358 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CASP10Q92851 521 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 HPS3Q969F9 1004 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 STRA6Q9BX79 667 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 MBTPS2O43462 519 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 FAM189A1O60320 539 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 B3GAT3O94766 335 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 EFEMP2O95967 443 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KLRC2P26717 231 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CASP1P29466 404 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 DSG1Q02413 1049 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SPAG1Q07617 926 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KCNC3Q14003 757 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 FAM212AQ96EL1 285 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KIF12Q96FN5 646 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 APOL5Q9BWW9 433 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.19■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PODXLO00592 558 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ADH1AP07327 375 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 EPCAMP16422 314 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 UPP1Q16831 310 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CEP57Q86XR8 500 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CHST7Q9NS84 486 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TTC26A0AVF1 554 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 LILRB3O75022 631 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SLFN14P0C7P3 912 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 ACOT2P49753 483 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 UNC13DQ70J99 1090 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 FSIP1Q8NA03 581 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TTPALQ9BTX7 342 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.17■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 LACTBL1A8MY62 500 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TEX28O15482 410 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SYKP43405 635 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 NDUFA8P51970 172 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 CUL4BQ13620 913 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 POSTNQ15063 836 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 RTP2Q5QGT7 225 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 TMEM206Q9H813 350 aa20.16■□□□□ 0.82
USP19-215ENST00000491859 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms