RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYLDQ9NQC7 956 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOBPA7XYQ1 873 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRM8O00222 908 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMA7O14818 248 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEB2O15479 319 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGGP02679 453 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGFR1P11362 822 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH3P22223 829 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTENP60484 403 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 WASHC5Q12768 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OGFOD2Q6N063 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 POTEHQ6S545 545 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CROCCP2Q86T23 111 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 VPS36Q86VN1 386 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC6Q86X45 466 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MORC4Q8TE76 937 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM161BQ96MY7 647 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX25Q9H3E2 840 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TXNDC9O14530 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP33O14559 1287 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACSL3O95573 720 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN2P17706 415 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC16A2P36021 539 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTAG1AP78358 180 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 STRN3Q13033 797 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC18A3Q16572 532 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMEL1Q495T6 779 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 JAMLQ86YT9 394 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAPBQ9H115 298 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRN3Q9NYV6 651 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBK1Q9UHD2 729 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 AK5Q9Y6K8 562 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM114B3SHH9 223 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC26A4O43511 780 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 BDNFP23560 247 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHBP35232 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PGM1P36871 562 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 MXI1P50539 228 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPC3P51654 580 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GK3PQ14409 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLR1Q15399 786 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROSER3Q2NL68 480 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP43Q70EL4 1123 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPERTQ8NA61 448 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 PARVBQ9HBI1 364 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 A8MU76 341 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 F8W8V4 182 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2CD2LO14523 706 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 AQP9O43315 295 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA2D3-210ENST00000490478 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms