RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 CDH19Q9H159 772 aa4.7□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.7□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 A0A0A6YYJ9 748 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PRSS38A1L453 326 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA12O60330 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 APOL3O95236 402 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CLUL1Q15846 466 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CT83Q5H943 113 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 FERMT2Q96AC1 680 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 UIMC1Q96RL1 719 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ORAI2Q96SN7 254 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MAST3O60307 1309 aa4.69□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 KLHL33A6NCF5 533 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PROP1O75360 226 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 FSBPO95073 299 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ADCY2Q08462 1091 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ODF1Q14990 250 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 UGT8Q16880 541 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CPA6Q8N4T0 437 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 C8orf48Q96LL4 319 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ZNF778Q96MU6 729 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.68□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 LEFTY2O00292 366 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 KCNAB3O43448 404 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RFPL1O75677 317 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ACAP2Q15057 778 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TOR2AQ5JU69 321 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TMEM240Q5SV17 173 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RAX2Q96IS3 184 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 SOX7Q9BT81 388 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 EDARQ9UNE0 448 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.67□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 UNC119BA6NIH7 251 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 OPHN1O60890 802 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 C1QL1O75973 258 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 LPLP06858 475 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 SPATA31D3P0C874 917 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MTNR1BP49286 362 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 RARRES1P49788 294 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TP53BP2Q13625 1128 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 KCNK18Q7Z418 384 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 ASB10Q8WXI3 467 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 JADE3Q92613 823 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 IL17RAQ96F46 866 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.66□□□□□ -1.66
PHC3-211ENST00000486042 TEKT5Q96M29 485 aa4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.3 ms