RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 UPP1Q16831 310 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 PLIN2Q99541 437 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 KCND2Q9NZV8 630 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 WNT16Q9UBV4 365 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTB-212ENST00000484841 H0YCG3 227 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PAPLNO95428 1278 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 FGFR3P22607 806 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 HOXA9P31269 272 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 RAB33AQ14088 237 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 KCNK18Q7Z418 384 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 DAW1Q8N136 415 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CEP120Q8N960 986 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CCL16O15467 120 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SRFP11831 508 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PLS3P13797 630 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ELF1P32519 619 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 UVSSAQ2YD98 709 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 HYIQ5T013 277 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CALML4Q96GE6 196 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 MTRRQ9UBK8 725 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PODXLO00592 558 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 TOM1L1O75674 476 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PLA2G4BP0C869 781 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 UBA7P41226 1012 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 MAPK7Q13164 816 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 RTL10Q7L3V2 364 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 BICD1Q96G01 975 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 I3L4J1 428 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ADAM12O43184 909 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 AOC1P19801 751 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 BRCC3P46736 316 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SNX27Q96L92 541 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 AK8Q96MA6 479 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PNMA5Q96PV4 448 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CDH7Q9ULB5 785 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CA14Q9ULX7 337 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 H7C4K7 107 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CLDN3O15551 220 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SLC26A4O43511 780 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 GFRA3O60609 400 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 BMP15O95972 392 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 KCNE1P15382 129 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 PROZP22891 400 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 XKR4Q5GH76 650 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ZPBP2Q6X784 338 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 MTSS1LQ765P7 747 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 LRG1P02750 347 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 MCM4P33991 863 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SLC12A3P55017 1021 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ARPP19P56211 112 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 NTHL1P78549 312 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 CNTN3Q9P232 1028 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-212ENST00000484841 ANHXE9PGG2 379 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PRRG1O14668 218 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 SYN3O14994 580 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 POU2F2P09086 479 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 NPR3P17342 541 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 HTR4Q13639 388 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ACTB-212ENST00000484841 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.01■■□□□ 1.11
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