RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-208ENST00000483670 KCNA1Q09470 495 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PSMD2Q13200 908 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 SEZ6Q53EL9 994 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 KRBA2Q6ZNG9 492 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF507Q8TCN5 953 aa28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 KCNA5P22460 613 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PTPN14Q15678 1187 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 USP41Q3LFD5 358 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 LEXMQ3ZCV2 418 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 EP400NLQ6ZTU2 488 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 EXOC1Q9NV70 894 aa28.11■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TRAPPC3O43617 180 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CYP3A5P20815 502 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CASP1P29466 404 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ADSSP30520 456 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TNFSF9P41273 254 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 GLUD2P49448 558 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 UPP1Q16831 310 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 ASB7Q9H672 318 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CHST7Q9NS84 486 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 DERAQ9Y315 318 aa28.1■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PER2O15055 1255 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 B3GAT3O94766 335 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 KIF4AO95239 1232 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 NDUFV1P49821 464 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CLCNKBP51801 687 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 DSG1Q02413 1049 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CREMQ03060 361 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TFF2Q03403 129 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 HPS3Q969F9 1004 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 FAM50BQ9Y247 325 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.09■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 LACTBL1A8MY62 500 aa28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 TISP43B9A030 160 aa28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 PDXDC1Q6P996 788 aa28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 KIF12Q96FN5 646 aa28.08■■■□□ 2.09
PDCD4-208ENST00000483670 F8W810 466 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 KLRC4O43908 158 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 LILRB3O75022 631 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 IL18RAPO95256 599 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 LTBRP36941 435 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 ACOT2P49753 483 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 FAM160A1Q05DH4 1040 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 HS2ST1Q7LGA3 356 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 NT5DC4Q86YG4 428 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 CASP10Q92851 521 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.07■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 PODXLO00592 558 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 RPN1P04843 607 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 KCNC3Q14003 757 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 ZBTB6Q15916 424 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 KMT5BQ4FZB7 885 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 SCFD1Q8WVM8 642 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 RABGGTAQ92696 567 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 C2CD2Q9Y426 696 aa28.06■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 LINC01565O15544 149 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 EXTL3O43909 919 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 TBX10O75333 385 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 KIF20AO95235 890 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 C1RP00736 705 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 LRPAP1P30533 357 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.05■■■□□ 2.08
PDCD4-208ENST00000483670 BEST2Q8NFU1 509 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms