RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CLUL1Q15846 466 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 UNC13DQ70J99 1090 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 HPS3Q969F9 1004 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 USP25Q9UHP3 1055 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TTC28Q96AY4 2481 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SYKP43405 635 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CLCNKBP51801 687 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FSIP1Q8NA03 581 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CLEC1BQ9P126 229 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.67■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 NDUFA8P51970 172 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CUL4BQ13620 913 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 KCNC3Q14003 757 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 USP41Q3LFD5 358 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TMEM206Q9H813 350 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CD207Q9UJ71 328 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 NCOR1O75376 2440 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.66■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TTC26A0AVF1 554 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 B3GAT3O94766 335 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 DSG1Q02413 1049 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 POSTNQ15063 836 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 UPP1Q16831 310 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 B3GALT6Q96L58 329 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CHST7Q9NS84 486 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 FAM50BQ9Y247 325 aa22.65■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 MUC3AQ02505 3323 aa22.64■■□□□ 1.22
NELFE-208ENST00000481121 ACOT2P49753 483 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CASP10Q92851 521 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KIF12Q96FN5 646 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PAGE5Q96GU1 130 aa22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PODXLO00592 558 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 LILRB3O75022 631 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 IL9P15248 144 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ADSSP30520 456 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SPAG1Q07617 926 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 EHHADHQ08426 723 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 FAM212AQ96EL1 285 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 LACTBL1A8MY62 500 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ADH1AP07327 375 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KLRC2P26717 231 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CD302Q8IX05 232 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
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