RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	KCNJ5	P48544	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	VAMP2	P63027	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	RAB32	Q13637	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	EFR3A	Q14156	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CCNG2	Q16589	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SNX22	Q96L94	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996		A6NCN8	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996		A6NLC8	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PSPN	O60542	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	INMT	O95050	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	FSBP	O95073	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MPIG6B	O95866	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	GNAI3	P08754	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CD8B	P10966	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	NPR1	P16066	1061 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PNLIP	P16233	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	ARFIP2	P53365	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	GNAI1	P63096	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MGAT5	Q09328	741 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MAPK7	Q13164	816 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	KIF22	Q14807	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	DGKD	Q16760	1214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996		F8W8V4	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIM38	O00635	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TEX33	O43247	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PAPLN	O95428	1278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	LRG1	P02750	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	HPX	P02790	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	POLB	P06746	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CELA3B	P08861	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MAL	P21145	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	RRM1	P23921	792 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CNTF	P26441	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	MC4R	P32245	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	TERF1	P54274	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	APBA1	Q02410	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KDM4C-208	ENST00000480996	PSMD6	Q15008	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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