RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 DERAQ9Y315 318 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.63■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 MYBP10242 640 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 BMP1P13497 986 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PAX3P23760 479 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PSMD2Q13200 908 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KANK3Q6NY19 840 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 FSIP1Q8NA03 581 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PAGE5Q96GU1 130 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ASB7Q9H672 318 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 DPP7Q9UHL4 492 aa20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PER2O15055 1255 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 TBX10O75333 385 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CXCL8P10145 99 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 AFMP43652 599 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CASP5P51878 434 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 NDUFA8P51970 172 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 FNIP2Q9P278 1114 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CD207Q9UJ71 328 aa20.61■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 TRIP11Q15643 1979 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 B3GAT3O94766 335 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KIF4AO95239 1232 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GLP2RO95838 553 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ADH1AP07327 375 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CA8P35219 290 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CUL4BQ13620 913 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB6Q15916 424 aa20.6■□□□□ 0.89
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SYF2-203ENST00000474160 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.6■□□□□ 0.89
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SYF2-203ENST00000474160 TTPALQ9BTX7 342 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CLEC1BQ9P126 229 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 C2CD2Q9Y426 696 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 A0A0C4DFX4 3053 aa20.6■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 LINC01565O15544 149 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 IL18RAPO95256 599 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ADSSP30520 456 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 LRPAP1P30533 357 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 TNFSF9P41273 254 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CLCNKBP51801 687 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KCNA1Q09470 495 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KIF12Q96FN5 646 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.59■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 LACTBL1A8MY62 500 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PODXLO00592 558 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ZNF202O95125 648 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KCNQ1P51787 676 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 SEZ6Q53EL9 994 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 BEST2Q8NFU1 509 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 EXOC1Q9NV70 894 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.58■□□□□ 0.89
SYF2-203ENST00000474160 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
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