RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	CLUH	O75153	1309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-215	ENST00000469307	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM189A1	O60320	539 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	RFPL2	O75678	378 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	UBA7	P41226	1012 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PSMD5	Q16401	504 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	KYAT1	Q16773	422 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CIT	O14578	2027 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MYH11	P35749	1972 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SYN3	O14994	580 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	B3GAT3	O94766	335 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP3A5	P20815	502 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CLCNKB	P51801	687 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	GRIN1	Q05586	938 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	STRN3	Q13033	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	REST	Q13127	1097 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	RAD54L	Q92698	747 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CLDN3	O15551	220 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAM12	O43184	909 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ABLIM3	O94929	683 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	CLTA	P09496	248 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	LIG1	P18858	919 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PLCG1	P19174	1290 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SYT1	P21579	422 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	LRPAP1	P30533	357 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	DDIT3	P35638	169 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	GTF2B	Q00403	316 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	NHLH1	Q02575	133 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	TDG	Q13569	410 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	DMD	P11532	3685 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PODXL	O00592	558 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	ASGR2	P07307	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PAX3	P23760	479 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	AVPR2	P30518	371 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PTPN5	P54829	565 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	MYADM	Q96S97	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A0B4J269	797 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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