RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	DPF3	Q92784	378 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ADCY5	O95622	1261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	EOMES	O95936	686 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TPM3	P06753	285 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GTF2H1	P32780	548 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	RGS19	P49795	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	UBXN1	Q04323	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	DERA	Q9Y315	318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PTGES	O14684	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TNNC2	P02585	160 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	FGFR1	P11362	822 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ACTN1	P12814	892 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	KCNE1	P15382	129 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PBX1	P40424	430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	AP3M2	P53677	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZACN	Q401N2	412 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	KRT39	Q6A163	491 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GAD1	Q99259	594 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PMM2	O15305	246 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	INPPL1	O15357	1258 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	P4HA2	O15460	535 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	EFCAB14	O75071	495 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	OFD1	O75665	1012 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SCNN1G	P51170	649 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	EPHB4	P54760	987 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	BIRC3	Q13489	604 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SYCP1	Q15431	976 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB6	Q15916	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	MIOS	Q9NXC5	875 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	SCN1A	P35498	2009 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996	GBF1	Q92538	1859 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1W2PQC6	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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