RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	INPPL1	O15357	1258 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH2	P05091	517 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB2	P25686	324 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBX3	P40426	434 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1G1	P47890	313 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF165	P49910	485 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMD6	Q15008	389 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPATA1	Q5VX52	437 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP37	Q86T82	979 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CWH43	Q9H720	699 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CIT	O14578	2027 aa		14.84	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC01553	A4QN01	128 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAPK13	O15264	365 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	VAMP7	P51809	220 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BCAR1	P56945	870 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DLG4	P78352	724 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUSC3	Q13454	348 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BEST2	Q8NFU1	509 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIFA	Q96CG3	184 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM84A	Q96KN4	292 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	AAAS	Q9NRG9	546 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DERA	Q9Y315	318 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C2CD2	Q9Y426	696 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		14.83	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BECN2	A8MW95	431 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	B4GALT3	O60512	393 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGEF15	O94989	841 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNA14	O95837	355 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNNC2	P02585	160 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAG3	P18627	525 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GUCY2F	P51841	1108 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYL5	Q02045	173 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	BFSP1	Q12934	665 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAB2	Q15742	525 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR49	Q8IV35	697 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMC2	Q8TDI7	906 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CGRRF1	Q99675	332 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPY26P	Q9H489	355 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CERS4	Q9HA82	394 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIP11	Q15643	1979 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GBF1	Q92538	1859 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL4A6	Q14031	1691 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRP1	O14786	923 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALT	P07902	379 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT19	P08727	400 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM49	P0CI25	452 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM49C	P0CI26	452 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTNNB1	P35222	781 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCNKB	P51801	687 aa		14.82	□□□□□ -0.04
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAP1	Q03518	808 aa		14.82	□□□□□ -0.04

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