RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.35■□□□□ 0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 UPP1Q16831 310 aa18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 AAK1Q2M2I8 961 aa18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-204ENST00000442563 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.35■□□□□ 0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 FUT10Q6P4F1 479 aa18.34■□□□□ 0.53
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RABGEF1-204ENST00000442563 PER2O15055 1255 aa18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 GLUD2P49448 558 aa18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-204ENST00000442563 FAM212AQ96EL1 285 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXL18Q96ME1 805 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB2Q96Q27 587 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
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