RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 KITP10721 976 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 BRAFP15056 766 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 DDIT3P35638 169 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 FMO1Q01740 532 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PFKPQ01813 784 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PPFIA1Q13136 1202 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SEPT2Q15019 361 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 GGT6Q6P531 493 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TEPPQ6URK8 271 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF527Q8NB42 609 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 OR10A5Q9H207 317 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CEP83Q9Y592 693 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MYO1FO00160 1098 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 AKR1B10O60218 316 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ENDOD1O94919 500 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TYRP14679 529 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 THBS2P35442 1172 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 NR1I3Q14994 352 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 VASNQ6EMK4 673 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MIB1Q86YT6 1006 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ABCF2Q9UG63 623 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 AGR2O95994 175 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CASP2P42575 452 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PMS2P11Q13670 270 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 RSPH3Q86UC2 560 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRK-212ENST00000434424 LILRA2Q8N149 483 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 DDX11Q96FC9 970 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SAMD11Q96NU1 681 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CD320Q9NPF0 282 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CPA4Q9UI42 421 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRK-212ENST00000434424 KDM5CP41229 1560 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRK-212ENST00000434424 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 M0R3H8 397 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 FFAR2O15552 330 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 THP07101 528 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ERVFC1P60507 584 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MAP3K12Q12852 859 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 DGKDQ16760 1214 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PROSER1Q86XN7 944 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 RNF152Q8N8N0 203 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 RAB24Q969Q5 203 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SKA1Q96BD8 255 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SUCLG2Q96I99 432 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRK-212ENST00000434424 RRN3Q9NYV6 651 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 EEA1Q15075 1411 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 PHF2O75151 1096 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 HPXP02790 462 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SYN1P17600 705 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 CTSSP25774 331 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 SMARCA1P28370 1054 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-212ENST00000434424 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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