RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 KLRF2D3W0D1 207 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 JMJD7P0C870 316 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CETPP11597 493 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 IFNAR1P17181 557 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 VCAM1P19320 739 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CNGA1P29973 690 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SLC1A4P43007 532 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 COG2Q14746 738 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 JAMLQ86YT9 394 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 NECAB1Q8N987 351 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 BRI3BPQ8WY22 251 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.54□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 BTBD19C9JJ37 291 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TMEM232C9JQI7 657 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 KPNA6O60684 536 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ADAMTS4O75173 837 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CKMP06732 381 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 HSPA6P17066 643 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 RXRAP19793 462 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 KIF5BP33176 963 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 MAP2K2P36507 400 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 BCL6P41182 706 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 GNAQP50148 359 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PKN1Q16512 942 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 KIZQ2M2Z5 673 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TREML2Q5T2D2 321 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 KCTD1Q719H9 257 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 GTF3C6Q969F1 213 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 GULP1Q9UBP9 304 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 FEM1BQ9UK73 627 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 PTPRFP10586 1907 aa7.52□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 RLFQ13129 1914 aa7.52□□□□□ -1.2
MED28P4-201ENST00000433137 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 NOTOA8MTQ0 251 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 VWA5AO00534 786 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 ATP2A1O14983 1001 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 NPHS1O60500 1241 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 EFEMP2O95967 443 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 SOD2P04179 222 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 NAT1P18440 290 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 FUT4P22083 530 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 SOX5P35711 763 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 SLC16A2P36021 539 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 HTRA3P83110 453 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 DUSP4Q13115 394 aa7.52□□□□□ -1.21
MED28P4-201ENST00000433137 PAK1Q13153 545 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms