RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 VSTM5A8MXK1 200 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 EDNRBP24530 442 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 CRHR1P34998 444 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-208ENST00000427110 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 CHN2P52757 468 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 INHBCP55103 352 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-208ENST00000427110 TBX4P57082 545 aa3.12□□□□□ -1.91
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