RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 IL9P15248 144 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 GLUD2P49448 558 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 CUL4BQ13620 913 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 SYCP3Q8IZU3 236 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 FSIP1Q8NA03 581 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 GLIS3Q8NEA6 775 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM212AQ96EL1 285 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.26■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.25■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 LACTBL1A8MY62 500 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 B3GAT3O94766 335 aa27.24■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 ACOT2P49753 483 aa27.24■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 KCNC3Q14003 757 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 KYAT1Q16773 422 aa27.24■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 USP41Q3LFD5 358 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 CNNM4Q6P4Q7 775 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 UROC1Q96N76 676 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 APOL5Q9BWW9 433 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa27.24■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.24■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC26A0AVF1 554 aa27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 KLRC2P26717 231 aa27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 ADSSP30520 456 aa27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 DSG1Q02413 1049 aa27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.23■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.23■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 CEP57Q86XR8 500 aa27.23■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQ64 194 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQD8 194 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 MBTPS2O43462 519 aa27.22■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 EPCAMP16422 314 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM26FQ5R3K3 315 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF12Q96FN5 646 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.22■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC28Q96AY4 2481 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 I3L4J1 428 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 PODXLO00592 558 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 POSTNQ15063 836 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 CASP10Q92851 521 aa27.21■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 USP25Q9UHP3 1055 aa27.21■■□□□ 1.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 VCANP13611 3396 aa27.2■■□□□ 1.95
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX28O15482 410 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 BRCC3P46736 316 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 RTP2Q5QGT7 225 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 TTPALQ9BTX7 342 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM206Q9H813 350 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM50BQ9Y247 325 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.2■■□□□ 1.94
HTATSF1-202ENST00000425695 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.19■■□□□ 1.94
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