RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417797.1

USP9YP13-201, Transcript of USP9Y pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP13, Length 480 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP13-201ENST00000417797 ITGB1P05556 798 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CCND1P24385 295 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CTXN1P60606 82 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RAP2BP61225 183 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 KLF10Q13118 480 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TMEM240Q5SV17 173 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ZNF529Q6P280 563 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TDP1Q9NUW8 608 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.83□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MARCH11A6NNE9 402 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NCR1O76036 304 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SLPIP03973 132 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 LAG3P18627 525 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NEK2P51955 445 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 IL10RAQ13651 578 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MED25Q71SY5 747 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SYNE4Q8N205 404 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CPA6Q8N4T0 437 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 IFI44Q8TCB0 444 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CEP89Q96ST8 783 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TEX101Q9BY14 249 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.82□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ADH4P08319 380 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PDGFRBP09619 1106 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SPATA31D3P0C874 917 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 GCSHP23434 173 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 BMPR1AP36894 532 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RAB39AQ14964 217 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 Q6ZPA2 131 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RSPH3Q86UC2 560 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TMX3Q96JJ7 454 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MLST8Q9BVC4 326 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PRSS23O95084 383 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CFIP05156 583 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ALAS1P13196 640 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 SLC6A2P23975 617 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 DSC2Q02487 901 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 FHL2Q14192 279 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ATP2B3Q16720 1220 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ZNF627Q7L945 461 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TTC7BQ86TV6 843 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 MIER2Q8N344 545 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 KAT5Q92993 513 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RAB24Q969Q5 203 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 PRRX2Q99811 253 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.8□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ALDH1L1O75891 902 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 NDUFA10O95299 355 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ABHD16AO95870 558 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ELANEP08246 267 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 CKBP12277 381 aa4.79□□□□□ -1.64
USP9YP13-201ENST00000417797 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms