RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417339.2

CENPVL3-201, Transcript of centromere protein V like 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL3, Length 864 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3-201ENST00000417339 H0Y858 1186 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CCL16O15467 120 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 NPR3P17342 541 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ARSHQ5FYA8 562 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SNX27Q96L92 541 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 TCHPQ9BT92 498 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PI15O43692 258 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 C1RP00736 705 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 C8AP07357 584 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PLS3P13797 630 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 FLCNQ8NFG4 579 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 STAMQ92783 540 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ACAP3Q96P50 834 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 MTRRQ9UBK8 725 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ANK1P16157 1881 aa23.49■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CFHP08603 1231 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 MCF2P10911 925 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PRRX2Q99811 253 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 PODXLO00592 558 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 LAMP2P13473 410 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 RAB33AQ14088 237 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 FBXL21Q9UKT6 434 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 POLIQ9UNA4 740 aa23.47■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 FSHRP23945 695 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SPAG1Q07617 926 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 LIN9Q5TKA1 542 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 SIX5Q8N196 739 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 UROC1Q96N76 676 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 TIPINQ9BVW5 301 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 CNTN3Q9P232 1028 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPVL3-201ENST00000417339 COL4A3Q01955 1670 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 KRBA1A5PL33 1030 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 KCNE1P15382 129 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 MCM2P49736 904 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 STRN3Q13033 797 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 HTR4Q13639 388 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 MCM6Q14566 821 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ITFG1Q8TB96 612 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 REEP2Q9BRK0 252 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 CA14Q9ULX7 337 aa23.45■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 TOM1L1O75674 476 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 PDXDC1Q6P996 788 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 GPBP1Q86WP2 473 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ANHXE9PGG2 379 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 CXCL8P10145 99 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 PLCG1P19174 1290 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 TNFSF9P41273 254 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 CLCN5P51795 746 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 SMTNP53814 917 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 NCKAP1LP55160 1127 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 ROR1Q01973 937 aa23.43■■□□□ 1.34
CENPVL3-201ENST00000417339 POTEHQ6S545 545 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms