RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 E7EVH7 732 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 EDN1P05305 212 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PGK2P07205 417 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GJB1P08034 283 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ATP4AP20648 1035 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GPD1LQ8N335 351 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CAND2O75155 1236 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 EMC2Q15006 297 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FBXO40Q9UH90 709 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 LYPLA2O95372 231 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SHBGP04278 402 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TNFRSF8P28908 595 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 JAMLQ86YT9 394 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 REPS2Q8NFH8 660 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SHC3Q92529 594 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.25■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CCDC188H7C350 402 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CD58P19256 250 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PIK3CAP42336 1068 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PRELID2Q8N945 189 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FMO2Q99518 471 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MYZAPP0CAP1 466 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RRM1P23921 792 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 LSP1P33241 339 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ZNF844Q08AG5 666 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ALCAMQ13740 583 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TMEM270Q6UE05 265 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 STBD1O95210 358 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FGFR4P22455 802 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 LY6KQ17RY6 165 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 KIFAP3Q92845 792 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 KLRG1Q96E93 195 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 IWS1Q96ST2 819 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.24■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 KIF3CO14782 793 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 DEPTORQ8TB45 409 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MDM1Q8TC05 714 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GPRASP2Q96D09 838 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CARD9Q9H257 536 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 K7ERI5 159 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 DGAT1O75907 488 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 HLA-DRAP01903 254 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TGFB2P61812 414 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 STRN3Q13033 797 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ZNF302Q9NR11 478 aa22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 RASSF9O75901 435 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CUL1Q13616 776 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 WLSQ5T9L3 541 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 PWWP2AQ96N64 755 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ANXA13P27216 316 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TNFSF9P41273 254 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 GNPTABQ3T906 1256 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.22■■□□□ 1.15
SPRN-201ENST00000414069 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms