RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 DUOXA2Q1HG44 320 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CCDC122Q5T0U0 273 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 VPS36Q86VN1 386 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TFR2Q9UP52 801 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TRIM17Q9Y577 477 aa31.75■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TMEM191BP0C7N4 346 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 GRK4P32298 578 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 SLC18A3Q16572 532 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 RSPH3Q86UC2 560 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TRIM10Q9UDY6 481 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa31.74■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 M0QZ92 97 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 B4GALT4O60513 344 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 NPTXRO95502 500 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 NCOA4Q13772 614 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TMEM40Q8WWA1 233 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 FAM81BQ96LP2 452 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 GUCA1BQ9UMX6 200 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 A0A087X0T9 212 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ABL1P00519 1130 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TNNC2P02585 160 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 FAM228BP0C875 321 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ANXA13P27216 316 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 NOTUMQ6P988 496 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB13Q8IY85 973 aa31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 RCCD1A6NED2 376 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 KRT86O43790 486 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 KIF5AQ12840 1032 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ZNF662Q6ZS27 426 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TXLNBQ8N3L3 684 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 BEGAINQ9BUH8 593 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 IMPG2Q9BZV3 1241 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TSGA10Q9BZW7 698 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa31.72■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 LACTBL1A8MY62 500 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 AXLP30530 894 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 GCNT1Q02742 428 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 SPOPLQ6IQ16 392 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 SLC27A1Q6PCB7 646 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 SESTD1Q86VW0 696 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 SHC3Q92529 594 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 ACAP3Q96P50 834 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 LACRTQ9GZZ8 138 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 TRPV2Q9Y5S1 764 aa31.71■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CABYRO75952 493 aa31.7■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CDY2AQ9Y6F7 541 aa31.7■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 MROH7Q68CQ1 1323 aa31.7■■■□□ 2.67
LMO2-202ENST00000395833 CASQ1P31415 396 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 GRM5P41594 1212 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 TRPC3Q13507 836 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 ZNF569Q5MCW4 686 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 SERINC5Q86VE9 423 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 FAM71AQ8IYT1 594 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 WDR24Q96S15 920 aa31.7■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 ACLYP53396 1101 aa31.69■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 NOP14P78316 857 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 ASB7Q9H672 318 aa31.69■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 ANK1P16157 1881 aa31.69■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 GRIN2DO15399 1336 aa31.69■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 NFICP08651 508 aa31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 PTGISQ16647 500 aa31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 SLC10A6Q3KNW5 377 aa31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 JADE1Q6IE81 842 aa31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 CTSHP09668 335 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 ITGA7Q13683 1181 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 WNT8BQ93098 351 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.663e-8■□□□□ 8.8
LMO2-202ENST00000395833 CST3P01034 146 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 KRT5P13647 590 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 TNFAIP3P21580 790 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 MYO1AQ9UBC5 1043 aa31.67■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 MOXD2PA6NHM9 499 aa31.66■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 CYP26A1O43174 497 aa31.66■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 MYL6P60660 151 aa31.66■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 CUL2Q13617 745 aa31.66■■■□□ 2.66
LMO2-202ENST00000395833 LHX8Q68G74 356 aa31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms