RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX27Q96L92 541 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PANX2Q96RD6 677 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK14Q9P0G3 267 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRN2O75325 713 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 NFICP08651 508 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGB8P26012 769 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC01599Q8WXQ3 324 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGS18Q9NS28 235 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIP11Q15643 1979 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TET1Q8NFU7 2136 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0U1RQF3 1178 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PMM2O15305 246 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARNO95453 639 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTN1P12814 892 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLCN1P35523 988 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZACNQ401N2 412 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALKAL1Q6UXT8 129 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM139Q8IV31 216 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAS1R2Q8TE23 839 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 LPPQ93052 612 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP58Q9BVL2 599 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF19AQ9NV58 838 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHB6O15197 1021 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXCL10P02778 98 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB27AP51159 221 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CETN1Q12798 172 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 BIRC3Q13489 604 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUOXA2Q1HG44 320 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCTN1Q2MV58 587 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPC2Q52LR7 807 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMO3Q8TAP4 145 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEPT8Q92599 483 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF623O75123 536 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA4P13612 1032 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD302Q8IX05 232 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEMA4DQ92854 862 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0355O15063 1070 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIMP1P01033 207 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM191BP0C7N4 346 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP3M2P53677 418 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM65Q6PJ69 517 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 HACE1Q8IYU2 909 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM130Q8N3G9 435 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF169Q8NCN4 708 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEK11Q8NG66 645 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTN3Q9P232 1028 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALPK3Q96L96 1907 aa29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOL4O94818 638 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM132DQ14C87 1099 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLRA4Q5JXX5 417 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF12Q96FN5 646 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTYH3Q9C0H2 523 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.381e-8■■■■■ 38.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPTLC3Q9NUV7 552 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB20Q9NX57 234 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPN11Q9UMQ6 739 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9IYK1 514 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 VNN1O95497 513 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT9P35527 623 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 APBB2Q92870 758 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIX2Q9NPC8 291 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABHD10Q9NUJ1 306 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2CD2Q9Y426 696 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNNC2P02585 160 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAG1P15918 1043 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 FIGNQ5HY92 759 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELMO3Q96BJ8 720 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHACTR2O75167 634 aa29.91■■■□□ 2.38
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