RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 PAK2Q13177 524 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ASIC2Q16515 512 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR59Q6PJI9 974 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 LACTBL1A8MY62 500 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 CKBP12277 381 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 MFAP3P55082 362 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 BFSP2Q13515 415 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM192Q8IY95 271 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SEMA4DQ92854 862 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.49■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 F8VZ95 297 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPING1P05155 500 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 FERP16591 822 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 GCNT1Q02742 428 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 NCOA4Q13772 614 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ZSCAN12O43309 604 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TRPC3Q13507 836 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 UBXN11Q5T124 520 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SNX27Q96L92 541 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SNTG2Q9NY99 539 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 ANXA13P27216 316 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SOX5P35711 763 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB27AP51159 221 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TAF4BQ92750 862 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC42Q96M95 316 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 GHRP10912 638 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 LPIN1Q14693 890 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 JADE1Q6IE81 842 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 GJB7Q6PEY0 223 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 PADI3Q9ULW8 664 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 VNN1O95497 513 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CD4P01730 458 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 NFICP08651 508 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 SKIP12755 728 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 PRKCIP41743 596 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 HELQQ8TDG4 1101 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CHP1Q99653 195 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 DEF6Q9H4E7 631 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CNTN3Q9P232 1028 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 IPPQ9Y573 584 aa26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CENPFP49454 3210 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 PITPNM1O00562 1244 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 XPOTO43592 962 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 RECQL4O94761 1208 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC175P0C221 793 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 GJA8P48165 433 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 SELPP16109 830 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 CD52P31358 61 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHDC3-201ENST00000379215 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms