RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376887.8

ABCC4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCC4, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4-201ENST00000376887 ALS2CLQ60I27 953 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 NT5C1BQ96P26 610 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 RMDN3Q96TC7 470 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 COX16Q9P0S2 106 aa8.31□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ITGA4P13612 1032 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 KCNJ1P48048 391 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 KCNMA1Q12791 1236 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SPP2Q13103 211 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 NAB2Q15742 525 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 RNF139Q8WU17 664 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 NYAP2Q9P242 653 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MAP2K7O14733 419 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TEX28O15482 410 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 APOA1P02647 267 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ARP10275 920 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 OSBPP22059 807 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PON1P27169 355 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PIK3CAP42336 1068 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 OSTNP61366 133 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MTMR1Q13613 665 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 RCN2Q14257 317 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 EFHBQ8N7U6 833 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 USP6NLQ92738 828 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ACCSQ96QU6 501 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MYH10P35580 1976 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TISP43B9A030 160 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MYO1FO00160 1098 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MED7O43513 233 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SNX2O60749 519 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 FMO5P49326 533 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ARL4DP49703 201 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TMC2Q8TDI7 906 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 VPS39Q96JC1 886 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 HACD3Q9P035 362 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CYP26A1O43174 497 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 FIGNQ5HY92 759 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CD58P19256 250 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CA4P22748 312 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DAB2P98082 770 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 OCRLQ01968 901 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 LRRC31Q6UY01 552 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 USP20Q9Y2K6 914 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.3□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MAPK4P31152 587 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 IMPG1Q17R60 797 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 C16orf87Q6PH81 154 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ACP6Q9NPH0 428 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SMARCA1P28370 1054 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 VAMP7P51809 220 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 SGO2Q562F6 1265 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ABCC4-201ENST00000376887 DENND3A2RUS2 1198 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms