RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CCDC51Q96ER9 411 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 TMEM106CQ9BVX2 250 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 TMX1Q9H3N1 280 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 PARP2Q9UGN5 583 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 SELPP16109 830 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 GUCY2FP51841 1108 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 TMEM139Q8IV31 216 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 IQCDQ96DY2 449 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 SNX27Q96L92 541 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 PANX2Q96RD6 677 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 C11orf49Q9H6J7 331 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 RAB20Q9NX57 234 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC12Q9UKB3 198 aa19.21■□□□□ 0.67
LTV1-201ENST00000367576 ANK1P16157 1881 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 BFSP2Q13515 415 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 GLRA4Q5JXX5 417 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC7Q99615 494 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 APEX2Q9UBZ4 518 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa19.2■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PMM2O15305 246 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TNNC2P02585 160 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TMEM132DQ14C87 1099 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 DUOXA2Q1HG44 320 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SPOPLQ6IQ16 392 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 KAT5Q92993 513 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 KIF12Q96FN5 646 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SPAG5Q96R06 1193 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 FAM105AQ9NUU6 356 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.19■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ARID5AQ03989 594 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 FAAP100Q0VG06 881 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 RNF169Q8NCN4 708 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 LPPQ93052 612 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 NT5C1BQ96P26 610 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ADAM2Q99965 735 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ASB7Q9H672 318 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CHST12Q9NRB3 414 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 BRCA2P51587 3418 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 KRT19P08727 400 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 NCOA4Q13772 614 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 DSC3Q14574 896 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PPM1KQ8N3J5 372 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TATDN2Q93075 761 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SCLYQ96I15 445 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 EDEM3Q9BZQ6 932 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 HIPK3Q9H422 1215 aa19.18■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 NRDCO43847 1150 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 NBNO60934 754 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 AP3M2P53677 418 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CCL23P55773 120 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 MTF1Q14872 753 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 WDR59Q6PJI9 974 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 USP38Q8NB14 1042 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CHP1Q99653 195 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.17■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CST3P01034 146 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 MYL6P60660 151 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TRPC3Q13507 836 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 C1orf127Q8N9H9 656 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 C1orf112Q9NSG2 853 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PCDH10Q9P2E7 1040 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SQORQ9Y6N5 450 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ITGB3P05106 788 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ITGA4P13612 1032 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CYP2C18P33260 490 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 JAM2P57087 298 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 WDR44Q5JSH3 913 aa19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms